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于婷: 基于RNA-seq数据的转录组重构算法

时间:2026-05-29 作者: 点击数:

报告时间:2026年5月30日(星期六)16:00-17:00

报告地点:科教楼B座1711

报  告  人:于婷 副研究员

工作单位:山东大学

举办单位:数学学院

报告简介:

基于RNA测序数据重构全长转录本是生物信息学中的重要研究问题。现有方法通常首先依据序列比对结果构建剪接图,随后利用组合优化算法在图中进行转录本路径重建。近年来,以PacBio和ONT为代表的第三代测序技术快速发展,显著提升了全长转录本重构能力。然而,主流算法在低丰度转录本的识别与恢复方面仍存在明显不足。为解决这一问题,本研究提出了一种整合原始长片段测序数据与人工打断的短片段的转录本重构策略,提高低丰度转录本的检测灵敏度和重构准确性。

报告人简介:

于婷,山东大学数学与交叉科学研究中心副研究员,博士生导师,博士毕业于山东大学数学学院,师从算法专家李国君教授。长期致力于数学与生命科学的交叉领域研究,在相关领域主持国家自然科学基金面上项目、青年基金项目,山东省自然科学基金青年项目,中国博士后科学基金面上项目,青岛市应用研究项目等;研究成果发表于Genome Research、Genome Biology,Bioinformatics等生物信息学顶级期刊.

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